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THE BOVINE GENE MAP: A TOOL FOR COMPARATIVE CANDIDATE POSITIONAL CLONING
EL MAPA GÉNICO BOVINO: UNA HERRAMIENTA PARA EL CLONAJE POSICIONAL COMPARATIVO

Womack, J.E.1,

1, Department of Veterinary Pathobiology. Texas A&M University. College Station, TX 77843. USA.

Additional keywords
Cattle gene map. Comparative map.
 
Palabras clave adicionales
Mapeo génico en bovino. Mapeo comparativo.
 
SUMMARY
The bovine genome map includes a synteny map, a linkage map and at least one in situ hybridization for each chromosome. Well over 1000 markers are placed on at least three published linkage maps. These markers are now being used to generate maps of economic trail loci (ETL) at an accelerating pace. The question of how to identify genes responsible for mapped ETL in cattle (and other livestock species) is a formidable one. One proposed approach is through comparative candidate positional cloning, in which candidate genes from the human and mouse maps are obtained from the bovine comparative map. It has become apparent that identification of conserved synteny between species is insufficient for comparative candidate positional cloning due to rearrangements of gene order that are abundant within conserved syntenic groups. To this end, our laboratory and others are ordering comparative mapping markers (Type I loci) on the bovine map. Examples of gene order on bovine chromosomes 1, 7 and 19 are presented to illustrate the orientation of and rearrangement within regions of conserved synteny in cattle, humans and mice. Ongoing experiments to further resolve gene order include an interspecific hybrid backcross and radiation hybrid somatic cell analysis.
 
RESUMEN
El mapa del genoma bovino incluye un mapa sinténico, un mapa de ligamiento y al menos uno de hibridación in situ para cada cromosoma. Bastante más de 1000 marcadores han sido localizados en al menos tres mapas de ligamiento publicados. Esos marcadores están siendo empleados ahora a un ritmo acelerado para generar mapas de loci de trascendencia económica (ETL). La cuestión de identificar los genes responsables de los ETL incluidos en el mapa del bovino (y de otras especies ganaderas) es formidable. Una propuesta para abordarla consiste en el clonaje de los candidatos posicionales comparativos, mediante el cual, se obtienen genes candidatos de los mapas del hombre y el ratón, a partir del mapa comparativo bovino. Esto ha puesto de manifiesto que la identificación de la sintenia conservada entre especies, es insuficiente para el clonaje del candidato posicional comparativo, a causa de los reordenamientos del orden de los genes que son abundantes dentro de los grupos de sintenia conservados. A este fin, nuestro laboratorio, y otros, se encuentran ordenando los marcadores para la elaboración de mapas comparativos (loci tipo I) en el mapa bovino. Para ilustrar la orientación y el reordenamiento dentro de regiones de sintenia conservada en bovinos, humanos y ratón, se presentan ejemplos del orden de los genes en los cromosomas bovinos 1, 7 y 19. Los experimentos en marcha, para finalmente aclarar el orden de los genes, incluyen un retrocruzamiento híbrido interespecifico y análisis por radiación de células somáticas híbridas.
 
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