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169 (Dec) pp 3-95
168 (Dec) pp 369-470
166-167 (Sep) pp 97-368
165 (Mar) pp 1-96
164 (Dec) pp 305-403
163 (Sep) pp 201-302
162 (Jun) pp 105-195
161 (Mar) pp 3-102
160 (Dec) pp 401-508
159 (Dec) pp 301-396
158 (Sep) pp 203-300
157 (Jun) pp 105-200
156 (Mar) pp 3-100
155 (Dec) pp 605-710
154 (Sep) pp 303-603
153 (Sep) pp 195-302
152 (Jun) pp 101-194
151 (Mar) pp 1-100
149 (Dec) pp 315-412
148 (Sep) pp 207-314
147 (Jun) pp 101-209
146 (Mar) pp 1-100
145 (Sep) pp 219-330
144 (Jun) pp 107-218
143 (Mar) pp 1-106
142 (Sep) pp 209-332
141 (Jun) pp 105-210
140 (Mar) pp 1-106
139 (Sep) pp 203-326
138 (Jun) pp 103-204
137 (Mar) pp 1-106
136 (Sep) pp 203-370
135 (Jun) pp 107-204
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133 (Sep) pp 209-332
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123 (Jun) pp 109-202
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120 (Jun) pp 113-216
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99 (Sep) pp 201-306
98 (Jun) pp 109-200
97 (Mar) pp 1-108
95-96 (Sep) pp 209-301
94 (Jun) pp 109-207
93 (Mar) pp 1-108
41 (Mar) pp 1-100
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MITOCHONDRIAL DNA D-LOOP ANALYSIS OF SOUTH WESTERN NIGERIAN CHICKEN
ANALISIS DE D-LOOP ADN MITOCONDRIAL DE POLLOS DE SW NIGERIA

Adebambo, A.O.1 and the Chicken Diversity Consortium*

1Department of Animal Breeding and Genetics. University of Agriculture. Abeokuta, P.M.B. 2240. Abeokuta. Naigeria. tumininuadebambo@yahoo.com *Chicken Diversity Consortium (Africa): G. Bjørnstad[a], W. Bulimo[b], H. Jianlin[a], G. Kierstein[a], L. Mazhani[d], B. Podisi[d], J. Hirbo[a], K. Agyemang[c], C. Wollny[e], T. Gondwe[l], V. Zeuh[f], D. Tadelle[g], G. Abebe[g], P. Abdoulaye[h], S. Paco[i], L. Serunjogi[j], M. Abrerrahman[f], R. Sow[h], S. Weigend[m], R. Sanfo[i], F. Gaye[c], E. Ssewanyana[j], M. D. Coulibaly[k], B. Teme[k], VSF (Sudan) and O. Hanotte[a]. [a]International Livestock Research Institute (ILRI). P.O. Box 30709. Nairobi 00100. Kenya. [b]Department of Biochemistry. University of Nairobi. P.O. Box 30197. Nairobi 00100. Kenya. [c]International Trypanotolerance Centre (ITC). The Gambia. [d]Agricultural Research. Private Bag 0033. Gaborone. Botswana. [e]Institute of Animal Breeding. Georg-August-Universität Göttingen. Germany. [f]Project de Développement Rural de la Préfecture du Lac (PDRPL). B.P. 782. N"Djamena. Tchad. [g]International Livestock Research Institute (ILRI). P.O. Box 5689. Addis Ababa. Ethiopia. [h]Institut Sénégalais de Recherches Agricoles. Dakar. Sénégal. [i]Institut de l"Environnement et de Recherches Agricoles (INERA). Ouagadougou. Burkina Faso. [j]Serere Agricultural and Animal Production Research Institute. Privatebag. Soroti. Uganda. [k]Institut d"Economie Rurale. P.O Box 258. Rue Mohamed V. Bamako. Mali. [l]Department of Animal Science. University of Malawi. Bunda College of Agriculture. Malawi. [m]Institute for Animal Breeding. Federal Agricultural Research Centre. Mariensee. Germany.

Additional keywords
Local poultry breeds. Genetic diversity. Haplotype. Phylogenetic tree.
 
Palabras clave adicionales
Razas aviares locales. Diversidad genética. Haplotipo. Árbol filogenético.
 
SUMMARY
Mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop segment was sequenced for a total of 98 individuals of domestic chicken from South Western Nigeria. Domestic chicken populations were: Anak titan (Israeli breed,n= 1), Frizzle (n= 16), Opipi (n= 5), FrizzleXOpipi (n= 5), Fulani (n= 4), Giriraja (Indian breed,n= 3), Normal (n= 55), Naked neck (n= 8), Yaffa (n= 1). The sequences of the first 397 nucleotides were used for the analysis. Seventeen haplotypes were identified in the samples, 15 for Nigerian indigenous chicken population, 1 for Giriraja and 1 for Anak titan from 23 polymorphic sites. Phylogenetic analysis shows that Nigerian indigenous and Anak titan chicken were all grouped under clade IV, while the Indian Giriraja was under clade IIIc. Clade IV had 16 haplotypes, while clade IIIc had one haplotype. AMOVA analysis indicates that 97.32% of the total sequence variation between haplotypes was present within population and 2.68% between populations. Our results suggest single multiple maternal origins for the South Western Nigerian domestic chicken.
 
RESUMEN
Un segmento D-loop de AND mitocondrial (mtADN) fue secuenciado para un total de 98 pollos domésticos de SW Nigeria. Las poblaciones domésticas de pollos fueron: Anak titan (raza israelí, n= 1), Frizzle (n= 16), Opipi (n= 5), FrizzlexOpipi (n= 5), Fulani (n= 4), Giriraja (raza india, n= 3), Normal (n= 55), Cuello Desnudo (n= 8), Yaffa (n= 1). Las secuencias de los primeros 397 nucleotidos fueron usadas para el análisis. Diecisiete haplotipos de 23 sitios polimórficos, fueron identificados en las muestras: 15 para las poblaciones indígenas nigerianas de pollos, 1 para Giriraja y 1 para Anak Titan. El análisis filogenético, muestra que los pollos indígenas nigerianos pueden agruparse todos dentro del clade IV, mientras que el Giriraja indio, se encuadró en el clade IIIc. El clade IV tiene 16 haplotipos mientras que el clade IIIc tiene sólo un haplotipo. El análisis AMOVA indica que el 97,32% de la variación total de la secuencia entre haplotipos estuvo presente dentro de la población y el 2,68% entre poblaciones. Los resultados sugieren un solo origen maternal múltiple para los pollos domésticos de SW Nigeria.
 
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