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168 (Dec) pp 369-470
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165 (Mar) pp 1-96
164 (Dec) pp 305-403
163 (Sep) pp 201-302
162 (Jun) pp 105-195
161 (Mar) pp 3-102
160 (Dec) pp 401-508
159 (Dec) pp 301-396
158 (Sep) pp 203-300
157 (Jun) pp 105-200
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154 (Sep) pp 303-603
153 (Sep) pp 195-302
152 (Jun) pp 101-194
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93 (Mar) pp 1-108
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RAPD MARKERS UTILIZATION ON THE FORMATION OR MAINTENANCE OF CONSERVATION NUCLEI OF LIVESTOCK SPECIES
USO DE MARCADORES RAPD EN LA FORMACIóN O MANTENIMIENTO DE NúCLEOS DE CONSERVACIóN DE ANIMALES DOMéSTICOS

Egito, A.A.*1, B. Fuck2, A.L. Spritze2, R.R. Oliveira3, C. McManus2, A.S. Mariante1, M.N. Ribeiro3, M.S.M. Albuquerque1, S.R. Paiva1, S.T.R. Castro1, S.A. Santos4,

1, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. PqEB – Final W5 Norte. Brasília-DF. Brasil.
2, Universidade de Brasília. Faculdade de Agronomia e Veterinária. Brasília-DF. Brasil.
3, Universidade Rural de Pernambuco. Recife-PE. Brasil.
4, Embrapa Pantanal. Caixa Postal 109. Corumbá-MS. Brasil. *E-mail: egito@cenargen.embrapa.br.

Additional keywords
Native breeds. Populations structure. Conser-vation genetics.
 
Palabras clave adicionales
Razas autóctonas. Estructura de poblaciones. Genética de la conservación.
 
SUMMARY
Genetic characterization is an essential issue in the conservation and breeding programs of any country. In these work we report the use of RAPD markers in population genetic study of three breeds of different species that are in Brazilian genetic conservation program. The objective was to analyze the genetic similarity of individuals of those populations breeds in order to contribute to ex situ and in situ conservation. The selection of animals with least genetic similarity can help to conserve the maximum variability within a population, and can even optimize the choice of breeders for ex situ conservation programs. These studies were carried out in the Animal Genetics Laboratory (AGL) at Embrapa"s Center for Genetic Resources and Biotechnology (CENARGEN). The native populations studied include: the Pantaneiro horse (in situ conservation nuclei), the bovine Crioulo Lageano (in situ conservation nuclei) and the Moxotó goat (five populations of these breed distributed in Northeast states). Using RAPD markers, obtained for each specie, we generated a Jaccard coefficient similarity matrix by NTSYS-pc v. 2.0 program. By the comparison between pairs of individuals we could chose those that were more similar between itself and those that were more distant. Using those matrix we suggested three kinds of procedure that could be used for helping the conservation of those breeds: the choice of the males to be semen donators - those less similar - avoiding duplication of samples (animals with high genetic similarity); the indication of preferential crossings aiming at the maintenance of the maximum genetic variability and the indication of animals for discarding - those that had high similarity - the breeder chose one of them for the discard. This kind of analysis could be done between two populations of the same breed in order to contribute to the genetic sample exchange between different nuclei. We must remember that these recommendations are based exclusively on genetic data and must lead in account the phenotypic characteristics of each animal, not having however to be considered separately.
 
RESUMEN
La caracterización genética es una materia esencial en los programas de conservación y de cría de cualquier país. En este trabajo informamos del uso de marcadores RAPD en el estudio de genética de poblaciones de tres razas de diferentes especies incluidas en los programas de conservación en Brasil. El objetivo fue analizar la similitud genética individual de aquellas poblaciones raciales para contribuir a su conservación ex situ e in situ. La selección de animales con menor similitud genética puede ayudar a conservar el máximo de variabilidad dentro de poblaciones y puede optimizar el trabajo de los criadores para los programas de conservación ex situ. Estos trabajos fueron realizados en el Laboratorio de Genética Animal (AGL) del Centro para los Recursos Genéticos y la Biotecnología (CENARGEN) de EMBRAPA. Las poblaciones nativas incluidas fueron: caballo Pantaneiro (núcleo de conservación in situ), el bovino Criollo Lageano (núcleo de conservación in situ), y la cabra Moxotó (cinco poblaciones de esta raza distribuidas en los estados del Nordeste). Usando marcadores RAPD, obtenidos para cada especie, generamos una matriz de coeficientes de similitud de Jaccard, mediante un programa NTSYS-pc v.2.0. Mediante la comparación entre pares de individuos podríamos escoger aquellos que fueron más similares entre ellos y aquellos que fueron más distantes. Usando estas matrices sugerimos tres tipos de procedimientos que podrían ser usados para apoyar la conservación de estas razas: la elección de machos para donantes de semen (animales con alta similitud genética); la indicación de apareamientos preferenciales buscando el mantenimiento de la máxima variabilidad genética y la indicación de animales a descartar -aquellos que tienen la máxima similitud- los criadores escogen uno de ellos para descartar. Este tipo de análisis podría realizarse entre dos poblaciones de la misma raza para contribuir al intercambio de individuos entre diferentes núcleos. Debemos recordar que estas recomendaciones están basadas exclusivamente en datos genéticos y debemos tener en cuenta las características fenotípicas de cada animal, no teniendo, de cualquier manera que ser consideradas separadamente.
 
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