El CEMEDE se crea con el objetivo de promover, potenciar y facilitar la investigación del caballo de deporte y su aplicación al sector productivo. Se trata de un centro único en España, por sus características, con una infraestructura científica-técnica especializada y de alto coste, necesaria y específica para la investigación en este tipo de caballos.

Ofrece apoyo científico y técnico a centros de investigación (Universidades, Organismos Públicos de Investigación) y entes privados (empresas, ganaderos, propietarios, jinetes, veterinarios…), para asesoramiento en diversos aspectos de la fisiología del ejercicio y la medicina deportiva equina, incluyendo diagnóstico de pérdida de funcionalidad y en el desarrollo de sus líneas de investigación.

El caballo de deporte requiere una atención veterinaria especializada e individualizada. Un rendimiento deportivo óptimo depende de un control riguroso e individual del entrenamiento, esencial además, para evitar lesiones músculo-esqueléticas, que pueden constituir el final de la vida deportiva del caballo. El diagnóstico de algunas enfermedades que hacen que el caballo no rinda lo que de él se espera, necesita la utilización de un equipamiento sofisticado, que solo poseen centros de referencia como el CEMEDE, único por sus características en España.