El VII Programa Marco se estructura en 4 subprogramas

Cooperación: Comprende actividades de investigación transnacional enfocadas en 10 “temas prioritarios”.

Ideas: Apoyará la investigación de excelencia, "impulsada por el investigador", que aumente la competitividad de Europa en todos los campos del conocimiento.

Personas: Constituye el apartado de formación y de movilidad del Programa Marco.

Capacidades: Engloba un conjunto de acciones entre las que destaca el apoyo a infraestructuras, regiones del conocimiento, ciencia y sociedad y cooperación internacional.