Caracterización genética y fenotípica de una población de cerdo pelón mexicano

Resumen

En cerdo pelón mexicano se analizó el pedigrí (n = 305), 16 variables morfológicas (VARMOR; n = 201) y 74 marcadores genéticos (SNP; n = 107) de uso en pruebas de paternidad. Se calculó: ancestros fundadores; tamaño efectivo (Ne); consanguinidad; intervalo generacional (IG); estadísticos F de Wright (FST, FIS y FIT). Las VARMOR fueron: longitud de cabeza, ancho de cabeza, longitud de hocico, ancho de hocico, longitud de oreja, ancho de orejas, distancia entre orbitales, altura a la cruz, ancho de pecho, circunferencia de pecho, longitud de cuello, ancho de cuello, perímetro de caña, longitud de cuerpo, ancho de pelvis, perímetro abdominal; se analizaron con el modelo mixto: y = μ + si + gj + β1 + β2 + mad + ε, donde: y, variable respuesta; μ, media; si, sexo; gj, granja; β1 y β2, lineal y cuadrático de la covariable edad del individuo; mad, efecto aleatorio de la madre; ε, residuales. Con la matriz de correlaciones se realizó un análisis de componentes principales. En los SNP se estimó el contenido de información polimórfica (PIC) y sus componentes, así como las probabilidades de no exclusión combinada (PNE). Ne = 92.10; ancestros que explican el 50% del pedigrí = 7; porcentaje de animales consanguíneos = 2.3%; consanguinidad promedio = 0.11%; IG promedio = 1.69 años. FST = 7%; FIS y FIT de -0.083 y -0.006, respectivamente. El mad explicó, en promedio, el 54.3% de la variabilidad. Para PIC, el promedio fue de 0.266 con valores en el intervalo de 0.018 a 0.375; las PNE fueron en el intervalo de 0.007 a 3.1E-22.