El CEMEDE se crea con el objetivo de promover, potenciar y facilitar la investigación del caballo de deporte y su aplicación al sector productivo. Se trata de un centro único en España, por sus características, con una infraestructura científica-técnica especializada y de alto coste, necesaria y específica para la investigación en este tipo de caballos.

El CEMEDE ofrece apoyo científico y técnico a centros de investigación (Universidades, Organismos Públicos de Investigación) y entes privados (empresas, ganaderos, propietarios, jinetes, veterinarios…), para asesoramiento en diversos aspectos de la fisiología del ejercicio y la medicina deportiva equina, incluyendo diagnóstico de pérdida de funcionalidad y en el desarrollo de sus líneas de investigación.