La Plataforma se encuentra ubicada en el Departamento de Química Analítica de la Universidad de Córdoba, en los laboratorios pertenecientes al Grupo de Investigación PAI FQM-227 “Plataformas analíticas en metabolómica/proteómica y explotación de residuos de la industria agroalimentaria”. Los laboratorios se distribuyen en la planta baja del Departamento en el ala derecha y se dividen en tres estancias principales: una de ellas para la preparación de muestras y las otras dos para la etapa de análisis:

• El laboratorio de preparación de muestra dispone de un conjunto completo de instrumentación suficiente para llevar a cabo el tratamiento de cualquier tipo de muestra, bien sea un líquido, un sólido o una suspensión. Para ello, la plataforma cuenta con sistemas de extracción, fuentes de energías auxiliares (microondas, ultrasonidos, líquidos sobrecalentados y fluidos supercríticos) y otros dispositivos tales como centrífugas o sistemas de agitación.
  
• En los laboratorios en los que se lleva a cabo la etapa de análisis se ubican instrumentos tales como cromatógrafos de líquidos y de gases, electroforesis capilar y el conjunto de analizadores de masas que conforman la Plataforma.
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• La Plataforma cuenta con sistemas de almacenamiento de muestra a temperaturas de 4, -20 y -80 ºC, dependiendo de las características de la muestra.
• También dispone de ordenadores y estaciones de trabajo para llevar a cabo el tratamiento del conjunto de datos que se generan en estudios metabolómicos.