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93 (Mar) pp 1-108
41 (Mar) pp 1-100
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GENETIC DIVERSITY AND POPULATION STRUCTURE IN REMNANT SUBPOPULATIONS OF NORDESTINO HORSE BREED
DIVERSIDADE GENéTICA E ESTRUTURA POPULACIONAL DE SUBPOPULAçõES REMANESCENTES DA RAçA EQUINA NORDESTINO

Pires, D.A.F.1*; Coelho, E.G.A.2; Melo, J.B.3; Oliveira, D.A.A.2; Ribeiro, M.N.1; Gus Cothran, E.4; Juras, R.4 and Khanshour, A.4

1Departamento de Zootecnia. Universidade Federal Rural de Pernambuco. Recife-PE. Brasil. *dna@zootecnista.com.br
2Laboratório de Genética da Escola de Veterinária. Universidade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte-MG. Brasil.
3Departamento de Estudos Básicos e Instrumentais. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia. Itapetinga-BA. Brasil.
4Department of Veterinary Integrative Biosciences. Texas A & M University. College Station, TX. USA.

Additional keywords
Allelic diversity. Bottleneck effect. Genetic structure. Microsatellite.
 
Palabras clave adicionales
Diversidade alélica. Efeito de gargalo genético. Estrutura genética. Microssatélite.
 
SUMMARY
This study analyzed four remnant subpopu-lations of Nordestino horse breed to detect genetic structure and diversity through 14 microsatellite markers. Hair root follicles from a total of 393 horses were collected. There were 61 animals from Salitre Valley (JUAZ-BA) located at Bahia state, 89 from North and Central North ecoregions located at Piauí state (NCEN-PI), 185 animals from Sertão and Sertão do São Francisco ecoregions (SERT-PE) and 58 animals from Agrestina city (AGRE-PE) located at Pernambuco state. Genetic diversity, genetic differentiation and bottleneck effects were examined in the 4 remnant subpo-pulations of Nordestino horse breed. There was high allelic diversity and the Fis value did not show evidence of a significant predominance of mating among relatives, probably because of crossbree-ding among populations. Recent bottleneck effects were not detected in the 4 subpopulations, but the IAM and TPM model did suggest a bottleneck effect. This may be a reflection of the decreased number of breeding animals caused by castration of males, mechanization processes and changes in life style in the rural areas. The bottleneck event was not enough to lead a genetic differentiation among the 4 remnant subpopulations of Nordestino horse. There was no evidence of genetic diffe-rentiation, so the 4 subpopulations formed one genetic group.
 
RESUMEN
O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura e diversidade genética de quatro subpopulações do cavalo Nordestino utilizando 14 marcadores microssatélites. Amostras de bulbo capilar de 393 cavalos foram coletadas, distribuídos em: 61 animais do vale do Salitre (JUAZ-BA) localizado no estado da Bahia, 89 das mesorregiões Norte e Centro-Norte do estado do Piauí, 58 animais da cidade de Agrestina (AGRE-PE) e 185 das mesorregiões Sertão e Sertão do São Francisco localizado no estado de Pernambuco (SERT-PE). A diversidade genética, diferenciação genética e efeito de gargalo genético foram avaliados nas 4 subpopulações do cavalo Nordestino. Observou-se elevada diversidade genética e valores de Fis que não evidenciaram níveis de consanguinidade significativa, prova-velmente isso se deve à acasalamentos entre as subpopulações. Efeito de gargalo genético recente não foi detectado para as quatro subpopulações, porém os modelos IAM e TPM sugeriram um efeito de gargalo genético não recente. Isso pode ser reflexo da redução no número de reprodutores decorrente da castração de machos, processo de mecanização e mudanças no estilo de vida das populações da zona rural. Eventos mais antigos do efeito de gargalo genético não foram suficientes para evidenciar uma diferenciação genética entre as 4 subpopulações, portanto elas formam um só grupo genético.
 
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